图书介绍
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- 何华勤主编 著
- 出版社： 北京：中国林业出版社
- ISBN：9787503859946
- 出版时间：2011
- 标注页数：216页
- 文件大小：62MB
- 文件页数：227页
- 主题词：蛋白质－基因组－高等学校－教材
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图书目录
第1章 绪论1
1.1 蛋白质组学的产生1
1.1.1 蛋白质组学的产生1
1.1.2 蛋白质组学与传统蛋白质化学4
1.2 蛋白质组学的发展5
1.2.1 蛋白质组学的发展特色5
1.2.2 蛋白质组学的研究内容6
1.2.3 蛋白质组学发展新趋势8
本章小结9
思考题9
参考文献10
第2章 蛋白质组学研究技术11
2.1 表达蛋白质组学12
2.1.1 蛋白质提取技术13
2.1.2 蛋白质分离技术15
2.1.3 蛋白质鉴定技术28
2.2 功能蛋白质组学31
2.2.1 酵母双杂交31
2.2.2 蛋白质芯片技术33
2.3 结构蛋白质组学34
2.3.1 X射线晶体衍射图谱法34
2.3.2 核磁共振35
本章小结37
思考题37
参考文献38
第3章 蛋白质双向电泳技术39
3.1 蛋白质样品制备的基本方法39
3.1.1 样品的破碎与裂解39
3.1.2 蛋白质的沉淀41
3.1.3 蛋白质组分的纯化42
3.1.4 裂解液的组成成分及其作用44
3.1.5 蛋白质的定量45
3.2 蛋白质分步提取及亚细胞蛋白质提取46
3.2.1 蛋白质一步提取法47
3.2.2 蛋白质分步顺序提取法47
3.2.3 亚细胞蛋白质提取48
3.3 一维等电聚焦电泳50
3.3.1 蛋白质是两性电解质50
3.3.2 pH梯度的形成52
3.3.3 等电聚焦电泳54
3.3.4 等电聚焦技术类型及其特点55
3.3.5 固相pH梯度技术55
3.4 二维SDS-聚丙烯酰氨凝胶电泳58
3.4.1 二维SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳的原理58
3.4.2 双向凝胶电泳技术的局限性及改进方法60
3.5 凝胶的染色、图形获取与分析62
3.5.1 凝胶的染色62
3.5.2 2-DE数字化图像的处理64
3.5.3 蛋白质胶上酶解72
本章小结73
思考题73
参考文献74
第4章 生物质谱鉴定蛋白质技术76
4.1 概述76
4.1.1 生物质谱仪的基本组成76
4.1.2 生物质谱仪的关键性能指标76
4.2 基质辅助激光解吸电离质谱77
4.2.1 离子化源78
4.2.2 TOF质量检测器80
4.3 电喷雾离子化质谱82
4.3.1 ESI工作原理82
4.3.2 质谱与其他技术的串联使用84
4.4 肽质量指纹图谱鉴定蛋白质技术85
4.4.1 肽质量指纹图谱鉴定蛋白质85
4.4.2 肽质量指纹图谱的优点及其局限性86
4.4.3 PMF检索工具86
4.4.4 PSD肽片段的部分测序技术89
4.5 串联质谱数据鉴定蛋白质技术90
4.5.1 串联质谱测定多肽序列原理91
4.5.2 串联质谱的优点及局限性92
4.5.3 肽序列标签鉴定技术92
4.5.4 18O标记从头测序技术93
4.5.5 其他蛋白质鉴定技术94
本章小结95
思考题95
参考文献96
第5章 蛋白质翻译后修饰98
5.1 磷酸化蛋白质的鉴定99
5.1.1 概述99
5.1.2 磷酸化蛋白质的检测方法100
5.1.3 磷酸化蛋白质或多肽的分离与富集101
5.1.4 磷酸化蛋白质的质谱检测与分析104
5.2 糖基化蛋白质的鉴定109
5.2.1 概述109
5.2.2 糖基化蛋白质的种类110
5.2.3 糖基化蛋白质的分离与富集技术113
5.2.4 糖基化蛋白质的解析114
本章小结116
思考题117
参考文献117
第6章 蛋白质组学的定量研究技术119
6.1 荧光定量蛋白质分析技术119
6.1.1 荧光染料染色技术119
6.1.2 2D-DIGE蛋白质组技术121
6.2 基于质谱的蛋白质组定量分析技术125
6.2.1 代谢标记126
6.2.2 提取后标记130
6.2.3 非同位素标记定量分析137
6.2.4 用AQUA肽绝对定量137
6.3 蛋白质芯片技术138
6.3.1 蛋白质芯片的分类139
6.3.2 蛋白质芯片的应用139
本章小结143
思考题143
参考文献143
第7章 蛋白质结构分析技术147
7.1 蛋白质的结构147
7.1.1 蛋白质结构的组织层次147
7.1.2 蛋白质结构的实验测定及结构基因组学150
7.1.3 蛋白质结构的分类152
7.1.4 蛋白质结构与功能的关系154
7.2 蛋白质结构比对155
7.2.1 蛋白质结构比对的原理156
7.2.2 常用的蛋白质结构比对方法157
7.3 蛋白质二级结构预测159
7.3.1 常用的二级结构预测方法160
7.3.2 不同二级结构预测方法的评价163
7.3.3 二级结构预测的展望164
7.4 蛋白质三级结构预测165
7.4.1 同源模拟165
7.4.2 折叠识别168
7.4.3 从头计算法172
本章小结176
思考题176
参考文献176
第8章 互作蛋白质组研究技术178
8.1 蛋白质-蛋白质相互作用的离体研究技术179
8.1.1 蛋白质亲和层析179
8.1.2 表面等离子共振技术179
8.2 酵母双杂交技术180
8.2.1 酵母双杂交技术的原理180
8.2.2 酵母双杂交技术的试验流程181
8.2.3 酵母双杂交技术的优缺点183
8.2.4 双杂交技术的新进展183
8.3 免疫共沉淀技术188
8.3.1 免疫共沉淀法的原理188
8.3.2 免疫共沉淀法的实验流程189
8.3.3 免疫共沉淀技术的应用190
8.4 蓝色非变性胶技术191
8.4.1 BN-PAGE技术的原理191
8.4.2 BN-PAGE技术的实验流程193
8.4.3 BN-PAGE的应用195
本章小结196
思考题196
参考文献196
第9章 蛋白质组信息学198
9.1 蛋白质组信息学简介198
9.1.1 蛋白质组信息学的产生与发展198
9.1.2 蛋白质组信息学的研究内容199
9.2 蛋白质组信息学资源200
9.2.1 蛋白质序列数据库200
9.2.2 蛋白质模式模体数据库PROSITE203
9.2.3 蛋白质结构数据库204
9.2.4 蛋白质结构分类数据库205
9.2.5 蛋白质互作网络数据库206
9.2.6 蛋白质功能信息学数据库208
9.3 蛋白质组信息学技术的应用211
9.3.1 序列比对211
9.3.2 结构预测213
9.3.3 药物筛选及设计214
本章小结215
思考题215
参考文献216