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第一部分 基础病理学——疾病机制3

1细胞死亡的分子机制3

引言3

细胞死亡的模式3

坏死和凋亡的结构特点4

坏死的细胞机制及分子机制6

细胞凋亡途径15

线粒体18

细胞核21

内质网21

溶酶体22

结语24

参考文献24

2急慢性炎症所致疾病的发病机制29

引言29

白细胞黏附、迁移和活化29

急性炎症和疾病发病机制32

模式识别受体和炎症反应33

慢性炎症和获得性免疫应答38

急、慢性炎症性疾病过程中的组织改建41

参考文献45

3感染和宿主反应49

微生物和宿主——力量的平衡？49

免疫应答的构成49

免疫调节51

病原体策略51

非洲锥虫和抗体多样性：与基因组的决斗52

金黄色葡萄球菌：细胞外的战场58

结核分枝杆菌和巨噬细胞64

单纯疱疹病毒：取代67

HIV：游击队员70

展望75

参考文献76

4肿瘤形成77

引言77

肿瘤的统计学与流行病学77

肿瘤性疾病的分类85

良性肿瘤与恶性肿瘤的特征95

肿瘤的临床表现99

参考文献101

第二部分 分子生物学与遗传学的概念107

5人类分子遗传学的基本概念107

引言107

DNA分子结构、DNA转录和蛋白质翻译107

分子病理学和DNA修复机制112

遗传方式116

中心法则和遗传学测试原理124

选择基因测试方法的注意事项127

总结132

参考文献132

6人类基因组：对人类疾病认识的影响133

引言133

人类基因组的结构和组织形式133

人类基因组概述136

人类基因组计划对疾病相关基因鉴定的影响139

人类基因组中变异的来源141

遗传疾病的类型142

遗传疾病和癌症144

展望146

参考文献147

7转录组在理解人类疾病中的意义150

引言150

基因表达谱：寻找致病基因150

基于基因芯片的转录组分析：技术前提154

基因芯片：生物信息学分析159

基因芯片：基础研究和转化医学中的应用169

前景180

参考文献183

8人类表观遗传学全基因组对了解人类疾病的启示184

引言184

基因组的表观遗传调控184

基因组印记185

癌症表观遗传学188

表观遗传学相关的人类疾病192

环境和表观遗传基因组196

参考文献197

9临床蛋白质组学和分子病理学200

在分子水平理解肿瘤：不断发展的前沿200

显微切割技术使分子分析进入组织层面201

血清蛋白质组学：肿瘤早期发现的新途径210

参考文献218

10整合系统生物学：理解人类疾病的意义220

引言220

数据生成221

数据整合225

建模体系226

理解疾病的启示227

讨论231

参考文献231

第三部分 分子病理学的原则与实践235

11病理：人类疾病的临床描述235

引言235

术语、定义和概念235

人类疾病治疗史的简要回顾236

病理学的现行方法243

将来的诊断病理学247

结论249

参考文献249

12理解分子发病机制：人类疾病的生物学基础和改进疾病治疗的启示251

引言251

C型肝炎病毒感染251

急性粒细胞性白血病255

囊性纤维化257

参考文献261

13分子与细胞发病学的整合：生物信息学的到来264

引言264

生物信息学的概述265

数据库资源266

数据分析268

生物信息学展望270

参考文献271

第四部分 人类疾病分子病理学275

14心血管疾病的分子基础275

引言275

心血管疾病的分子总论275

心血管器官的细胞276

动脉粥样硬化282

缺血性心脏病287

动脉瘤287

血管炎288

瓣膜性心脏病289

心肌病293

参考文献299

15 血栓与出血性疾病的分子基础301

凝血系统简介301

可溶性凝血因子病304

纤溶系统紊乱313

血小板数量或功能紊乱313

易栓症319

参考文献321

16淋巴和髓系疾病的分子基础324

造血和淋巴器官的发育324

髓系疾病331

淋巴细胞疾病343

参考文献353

17免疫疾病的分子基础357

引言357

正常的免疫系统357

主要的综合征364

参考文献376

18肺疾病的分子基础377

引言377

肺肿瘤性疾病和胸膜疾病377

非肿瘤性肺疾病401

阻塞性肺疾病402

间质性肺疾病411

肺血管疾病421

肺部感染425

肺组织细胞疾病438

肺职业病441

发育异常443

参考文献446

19胃肠道疾病的分子基础452

引言452

胃癌452

结肠直肠癌460

参考文献478

20肝脏疾病的分子基础486

引言486

肝脏发育的分子基础486

肝脏再生的分子基础489

健康及疾病状态下的成体肝脏干细胞491

肝细胞死亡的分子基础493

非酒精性脂肪肝的分子基础495

酒精性肝病的分子基础500

肝纤维化和肝硬化的分子机制502

肝脏肿瘤的分子基础504

参考文献509

21胰腺外分泌部疾病的分子基础516

急性胰腺炎516

慢性和遗传性胰腺炎523

总结528

参考文献528

22内分泌系统疾病的分子基础532

引言532

垂体532

甲状腺539

甲状旁腺550

肾上腺555

青春期561

致谢568

参考文献568

23妇产科疾病发生的分子基础572

引言572

女性生殖道的良、恶性肿瘤572

与怀孕相关的疾病589

参考文献595

24前列腺癌的分子机制：体细胞学、表观遗传学和遗传学的改变601

引言601

前列腺癌风险度的遗传相关性602

体细胞的基因表达改变602

表观遗传学606

前列腺癌小鼠模型的进展608

结论611

致谢611

参考文献611

25乳腺癌的分子病理学616

引言616

传统的乳腺癌分类616

生物标记619

基因表达谱627

结论632

参考文献633

26皮肤疾病的分子基础637

引言637

皮肤疾病及其影响637

健康皮肤的分子基础638

皮肤发育和维持研究为疾病的分子机制提供了新的见解641

孟德尔遗传性皮肤疾病的分子病理学644

常见炎症性皮肤疾病的分子病理652

皮肤蛋白作为遗传性和获得性疾病的靶点657

皮肤肿瘤分子病理662

皮肤疾病的分子诊断667

更新的分子机制和新颖的治疗方法670

参考文献674

27分子病理学：神经病理学676

中枢神经系统解剖学676

神经发育异常680

神经损伤：脑卒中、神经退行性变和神经毒剂692

肿瘤707

髓鞘蛋白疾病715

参考文献720

第五部分 分子医学的应用723

28人类疾病的分子诊断723

引言723

分子诊断的发展历程723

分子实验室亚专业725

未来应用737

参考文献739

29临床实验室的人类疾病分子评价740

引言740

分子技术在感染性疾病诊断中的应用741

分子诊断应用新范例743

BCR-ABL：一个新的分子应用范例746

结论748

参考文献749

30人类疾病治疗的药物基因组学和个体化医疗750

引言750

结论760

参考文献760