图书介绍
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- 马文丽，郑文岭主编 著
- 出版社： 北京：化学工业出版社
- ISBN：9787122149855
- 出版时间：2012
- 标注页数：190页
- 文件大小：21MB
- 文件页数：209页
- 主题词：基因工程－实验
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图书目录
第一章 概述1
第一节 基因测序的历史1
第二节 基因测序技术进展2
一、第一代基因测序技术3
二、第二代基因测序技术4
三、第三代基因测序技术7
第三节 基因测序的应用9
参考文献10
第二章 双脱氧测序法12
第一节 双脱氧链终止法的概念与原理12
一、双脱氧链终止法的概念13
二、双脱氧链终止法的原理13
第二节 双脱氧链终止法的操作步骤18
一、变性双链模板的制备19
二、延伸和终止反应20
三、测序反应物电泳和序列读取21
参考文献21
第三章 RNA测序23
第一节 转录组概念及研究意义23
一、转录组概念23
二、转录组研究的意义24
第二节 RNA测序技术方法25
一、表达序列标签技术25
二、表达系列分析技术30
三、新一代高通量测序技术（RNA-seq）36
四、单分子测序技术39
小结41
参考文献41
第四章 合成法DNA测序的集成系统43
第一节 Roche/454 FLX测序的基本原理及操作流程46
一、背景介绍46
二、454测序法的原理48
三、454生命科学皮升级测序系统流程48
四、应用前景50
第二节 Illumina/Solexa Genome Analyzer测序的基本原理及操作流程52
一、Illumina/Solexa Genome Analyzer测序的基本原理53
二、Illumina/Solexa Genome Analyzer测序的操作流程54
三、Illumina/Solexa Genome Analyzer测序的技术优势55
四、Illumina/Solexa Genome Analyzer测序的应用56
第三节 Applied Biosystems SOLiD system57
一、Applied Biosystems SOLiD system测序的基本原理57
二、Applied Biosystems SOLiD system测序的操作流程58
三、Applied Biosystems SOLiD system测序的技术优势58
四、Applied Biosystems SOLiD system测序的应用59
小结59
参考文献60
第五章 全基因组水平的单分子测序62
第一节 单分子测序简介62
一、单分子测序技术的出现62
二、单分子测序技术的分类63
第二节 Heliscope单分子测序技术65
一、基本原理65
二、tSMS技术流程65
三、Heliscope单分子测序技术的特点67
第三节 单分子实时技术68
一、基本原理68
二、smrt技术流程71
第四节 纳米孔单分子技术71
一、基本原理71
二、纳米孔测序技术的特点75
三、纳米孔测序技术要面临的挑战76
小结78
一、三代测序技术的对比78
二、单分子测序技术的应用81
参考文献82
第六章 基因组测序与拼接84
第一节 序列拼接简介84
第二节 序列拼接85
一、常用算法85
二、常用拼接软件88
第三节 基因组组装95
一、组装策略95
二、常见问题96
三、组装结果检验96
四、组装后生物信息学分析97
第四节 新基因发现97
一、基因简介97
二、基因组挖掘98
三、发现基因的一般过程99
第五节 基因组注释104
小结105
参考文献106
第七章 基因测序的应用108
第一节 基因组研究108
一、PCR克隆测序验证108
二、突变体检测110
三、新基因组检测113
四、全基因组检测115
五、系统发育及物种鉴定120
第二节 临床研究122
一、个体识别——亲缘鉴定122
二、SNP关联分析124
三、临床疾病诊断应用126
第三节 食品安全检测127
一、常规微生物检测127
二、突发食品事件检测128
三、转基因食品检测129
小结130
参考文献131
第八章 表观遗传测序136
第一节 甲基化测序137
一、DNA甲基化概述137
二、DNA甲基化测序方法138
第二节 ChIP测序150
参考文献165
第九章 基因组图谱167
第一节 人类基因组计划167
一、中美英联合启动“千人基因组计划”167
二、“炎黄计划”170
三、韩国人基因组图谱171
四、日本人基因组图谱171
第二节 癌症及其他疾病的基因组图谱172
一、癌症基因组图谱分析172
二、其他疾病基因组图谱分析175
第三节 经济作物基因测序图谱175
一、小麦基因组图谱175
二、木瓜基因组图谱176
三、大豆基因组图谱177
四、马铃薯基因组图谱177
五、玉米基因组图谱179
六、草莓基因组图谱180
七、可可树基因组图谱180
八、高粱基因组图谱180
第四节 模式生物基因测序图谱182
一、猩猩基因组图谱182
二、大熊猫基因组图谱182
三、疟原虫基因组图谱183
四、霉菌基因组图谱185
五、拟南芥基因组图谱185
六、水稻基因组图谱186
七、果蝇基因组图谱187
第五节 其他生物基因组测序187
一、中国人参基因组图谱187
二、鸭嘴兽基因组图谱188
参考文献188