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动物育种中的统计计算 Julia语言应用
  • 梅步俊著 著
  • 出版社: 北京:中国农业科学技术出版社
  • ISBN:9787511627001
  • 出版时间:2016
  • 标注页数:322页
  • 文件大小:30MB
  • 文件页数:337页
  • 主题词:程序语言-应用-动物-育种-生物统计-计算方法

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图书目录

第一章 Julia语言使用说明1

第一节 Julia语言简介2

第二节 Julia语言基础8

第二章 系谱数据处理方法27

第一节 近交系数与亲缘系数28

第二节 分子血缘相关矩阵及其逆矩阵计算32

第三节 计算实例43

第三章 动物遗传育种中的数据模拟49

第一节 随机数和随机变量的产生49

第二节 误差计算51

第三节 使用Julia语言模拟数据55

第四节 计算实例62

第五节 基因组模拟软件XSim65

第四章 线性模型的建立和求解73

第一节 单因子模型73

第二节 二因子模型81

第三节 建立Henderson混合模型方程组90

第五章 线性模型的扩展105

第一节 有重复记录的动物模型105

第二节 母体效应模型116

第六章 多性状模型121

第一节 多性状模型122

第二节 Julia语言实现多性状模型125

第三节 带有缺失数据的多性状模型132

第七章 分子标记和多基因效应单性状模型151

第一节 标记辅助选择151

第二节 混合模型方程组的储存技术154

第三节 Julia语言示例165

第八章 MCMC算法173

第一节 贝叶斯统计173

第二节 Julia语言的实现179

第三节 贝叶斯统计在多元线性模型中的应用186

第四节 贝叶斯统计示例192

第五节 多性状模型的Gibbs抽样205

第六节 思考题解答212

第九章 全基因组统计分析221

第一节 基于Haseman-Elston回归的全基因组连锁分析222

第二节 多元混合线性模型234

第三节 贝叶斯GWAS240

第四节 单步全基因组分析方法246

第五节 GBLUP的准确性250

第六节 Julia语言示例254

第十章 附录269

第一节 线性模型简介271

第二节 基于系谱的混合线性模型273

第三节 预测SNP效应的固定效应模型276

第四节 结合有基因型和无基因型家畜数据282

第五节 贝叶斯GWAS基础287

第六节 统计基因组学基础294

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