图书介绍
分子生态学与数据分析基础PDF|Epub|txt|kindle电子书版本网盘下载
- 王峥峰著 著
- 出版社： 北京：科学出版社
- ISBN：9787030464781
- 出版时间：2016
- 标注页数：219页
- 文件大小：94MB
- 文件页数：227页
- 主题词：分子生物学－生态学－数据处理
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图书目录
第一部分 分子生态学理论3
第一章 分子生态与遗传变异3
第一节 遗传变异的产生3
第二节 分子标记的种类5
第三节 遗传变异的衡量7
第四节 遗传变异的维持、丧失11
第二章 分子生态学研究内容18
第一节 个体与物种区分、鉴定（差异与多样性）18
第二节 基因流和适应23
第三节 小种群28
第二部分 分子生态数据获得与分析——以微卫星体分子标记为例35
第三章 分子遗传标记的获得——微卫星体35
第一节 微卫星体获得：MsatCommander、inGAP、MicroFamily和GelQuest软件35
第二节 微卫星体数据初步整理分析：GenAlEx软件及其遗传多样性大小衡量55
第四章 遗传变异状况61
第一节 Hardy-Weinberg平衡检测：Genepop、SGoF＋软件61
第二节 连锁不平衡检测：Genepop软件68
第三节 等位基因丰富度比较：ADZE软件70
第五章 遗传分化74
第一节 FST分析：Genetix软件74
第二节 AMOVA分析：GenAlEx软件78
第六章 分组分析83
第一节 Structure软件分析及CONVERT、Structure Harvester、CLUMPP软件83
第二节 TESS软件分析及PAST、TESS Ad-Mixer软件114
第七章 空间遗传结构分析132
第一节 sPCA分析132
第二节 Alleles in space和Surfer软件149
第三节 空间自相关分析：SPAGeDi软件159
第四节 空间遗传结构的异向性：PASSaGE软件和R程序166
第八章 景观遗传学分析183
第一节 表面距离：ArcGIS软件183
第二节 加权线性距离、最小成本距离和阻抗距离：R程序198
第三节 Mantel test和Partial Mantel test：PASSaGE软件206
参考文献214