生态基因组学PDF|Epub|txt|kindle电子书版本网盘下载

生态基因组学PDF格式电子书版下载

注意：本站所有压缩包均有解压码： 点击下载压缩包解压工具

第一部分 生态基因组学概论3

第1章 生态基因组学：当生态学遇到基因组学3

1.1 什么是生态基因组学3

1.2 生态学的发展趋势3

1.3 生态基因组学的形成过程6

1.4 生态基因组学主要研究的问题和挑战8

1.5 生态基因组学研究的实例——飞蝗表型可塑性研究9

参考文献12

第2章 高通量测序技术及其在生态基因组学上的应用15

2.1 高通量测序技术介绍15

2.2 测序技术在生态基因组学研究中的应用21

2.3 小结31

参考文献32

第3章 生态基因组学研究中的生物信息学方法34

3.1 高通量测序数据的质控分析34

3.2 遗传变异的识别35

3.3 非模式生物基因组的拼接37

3.4 非模式生物中基因识别的方法39

3.5 系统发育树构建41

3.6 微生物生态基因组研究的常用工具42

参考文献44

第4章 细胞器基因组及其在生态学和进化学中的应用48

4.1 细胞器基因组的结构及特点49

4.2 细胞器基因组测序及分析51

4.3 线粒体和叶绿体基因组的应用53

4.4 小结57

参考文献58

第5章 微生物生态功能基因检测方法61

5.1 功能基因的分子检测方法61

5.2 碳循环功能基因的分子检测63

5.3 氮循环功能基因的分子检测68

5.4 小结73

参考文献74

第二部分 生态基因组学的热点科学问题83

第6章 环境胁迫适应的生态基因组学83

6.1 生物对环境胁迫的响应与适应：总论83

6.2 温度胁迫适应的生态基因组学84

6.3 低氧胁迫适应的生态基因组学85

6.4 全球变化／全球变暖的生态基因组学87

6.5 环境胁迫的表观遗传：表观基因组学89

6.6 热激蛋白家族与环境胁迫响应91

6.7 展望93

参考文献93

第7章 组学与昆虫神经行为学——以飞蝗型变的神经行为学机制研究为例98

7.1 神经行为学98

7.2 昆虫神经行为学100

7.3 飞蝗行为型变与行为决策100

7.4 基于组学的飞蝗行为型变的神经行为学机制研究101

7.5 基于组学数据发现的单胺类神经递质对飞蝗行为型变的调节105

7.6 展望108

参考文献108

第8章 昆虫生殖调控及适应的生态基因组学112

8.1 基因组及生殖相关基因112

8.2 生殖内分泌调控通路114

8.3 生殖调控的表观作用机制118

8.4 生殖调控与环境适应120

8.5 生殖调控的应用123

参考文献125

第9章 昆虫多型现象的基因组学研究131

9.1 昆虫多型现象131

9.2 多型性昆虫的基因组测序和比较研究133

9.3 昆虫多型现象的分子调控机制136

9.4 昆虫多型现象的表观调控机制141

9.5 展望143

参考文献143

第10章 生态免疫学148

10.1 物种免疫系统多样性148

10.2 生态因子对免疫系统的影响149

10.3 宿主免疫防御策略的生态适应性152

10.4 群体性免疫154

10.5 密度依赖的预先免疫分子机制155

参考文献156

第11章 昆虫免疫组学160

11.1 模式昆虫的免疫组学160

11.2 卫生昆虫的免疫组学168

11.3 免疫互作及免疫进化173

11.4 免疫基因的比较和进化176

11.5 展望179

参考文献180

第12章 不同生态环境中昆虫体色的多型性及其调控机制187

12.1 环境对昆虫体色的影响187

12.2 昆虫体色多型的内分泌调控机制192

12.3 昆虫体色多型的遗传机制194

参考文献201

第13章 生态基因组学在动物物种形成研究中的应用205

13.1 全基因组已被揭示的主要动物类群及基因组大小的演化205

13.2 动物物种形成的特点和机制207

参考文献218

第14章 植物适应性进化的研究221

14.1 植物的适应性222

14.2 植物适应性进化的研究方法223

14.3 植物适应性进化的研究进展223

14.4 植物适应性进化研究中存在的问题227

参考文献228

第15章 植物对环境中生物胁迫的组学防御反应231

15.1 病原相关分子对防御基因的系统激活231

15.2 R基因的系统激活及抗性作用233

15.3 RNA沉默对病原入侵的直接及间接防御235

15.4 局部抗性与系统获得性抗性240

15.5 抗性反应的跨代传递机制243

参考文献245

第16章 生态适应过程中非编码RNA的表达调控机制250

16.1 以长链非编码增强子RNA为核心的表达调控机制250

16.2 以短链非编码piRNA为核心的表达调控机制253

16.3 生态适应过程中非编码RNA的表达调控机制258

参考文献261

第17章 植物－昆虫互作的生态基因组学研究265

17.1 在基因组水平研究植物对昆虫取食的响应和对策265

17.2 利用基因组芯片研究植物与植物化学通讯的机制273

17.3 利用基因组研究昆虫嗅觉对寄主信息流的行为适应机制280

17.4 植食性昆虫寄主专化的基因组适应机制281

参考文献284

第18章 唾液蛋白调控昆虫适应植物的生态基因组学研究288

18.1 昆虫唾液蛋白的组成288

18.2 唾液蛋白在昆虫与植物互作中的作用297

18.3 唾液蛋白在昆虫寄主转换中的作用300

参考文献302

第19章 吸血节肢动物与哺乳动物的互作基因组学307

19.1 吸血节肢动物与病原传播307

19.2 吸血节肢动物与哺乳动物互作310

参考文献315

第20章 昆虫－病毒互作的生态基因组学研究319

20.1 昆虫作为宿主与病毒的关系319

20.2 昆虫作为介体与病毒的关系326

参考文献333

第21章 介体昆虫肠道微生态与病原微生物的传播337

21.1 昆虫肠道结构与功能337

21.2 肠道菌群的基本功能339

21.3 昆虫细胞内共生菌342

21.4 肠道菌群的结构及其在宿主体内的维持343

21.5 介体昆虫肠道菌群与病原微生物的传播345

参考文献347

第22章 宏基因组在昆虫－植物－伴生微生物互作中的应用354

22.1 伴生微生物群落结构与重要功能关联分析356

22.2 伴生微生物宏基因组解析与重要功能预测359

参考文献362

第三部分 生态基因组学的未来科学问题及应用367

第23章 分子微生态学的兴起与宏基因组学的诞生367

23.1 人体分子微生态学的兴起367

23.2 宏基因组学的诞生368

23.3 宏基因组学技术在人体微生态研究中的应用369

23.4 宏基因组学技术在人体微生态研究中的展望374

参考文献374

第24章 水生生态系统的宏基因组学研究——环境胁迫的生态效应及方法学研究376

24.1 水生生态系统遭受的环境胁迫376

24.2 利用宏基因组学技术研究环境胁迫产生的生态学效应379

24.3 水生生态系统的宏基因组学研究存在的问题及可能的解决方案382

24.4 小结与展望388

参考文献388

第25章 生态环境与流感病毒基因的变异393

25.1 引言393

25.2 流感病毒概述394

25.3 流感病毒的天然宿主396

25.4 流感病毒的传播途径397

25.5 流感病毒的基因变异399

25.6 候鸟迁徙与流感病毒传播403

25.7 生态环境改变对流感病毒传播的影响404

25.8 小结405

参考文献406

第26章 人体微生物组与慢性疾病412

26.1 人体微生物组412

26.2 肠道菌群：新发现的人体器官413

26.3 人体肠道菌群和慢性疾病417

26.4 调节肠道菌群防治慢性病423

26.5 小结425

参考文献425