图书介绍

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计算机辅助药物设计 原理、方法及应用
  • 陈凯先等主编 著
  • 出版社： 上海：上海科学技术出版社
  • ISBN：7532355519
  • 出版时间：2000
  • 标注页数：487页
  • 文件大小：18MB
  • 文件页数：494页
  • 主题词：

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图书目录

第一章 绪论1

1.1 引言1

1.2 药物先导化合物的发现2

1.3 计算机辅助药物设计的策略4

1.4 计算机辅助药物设计成功的例子7

1.5 结语15

参考文献17

第二章 量子化学计算方法22

2.1 引言22

2.2 药物和生物分子计算的量子化学方法23

2.3 环境的影响——溶剂效应的理论计算方法54

2.4 生物大分子量子化学计算方法63

2.5 结语71

参考文献71

第三章 分子力学76

3.1 引言76

3.2 理论方法77

3.3 构象分析方法91

3.4 分子力学在药物设计中的应用97

3.5 结语101

参考文献101

第四章 配体-受体相互作用及其结合自由能的理论计算106

4.1 引言106

4.2 配体-受体相互作用的热力学过程107

4.3 分子动力学与自由能微扰方法111

4.4 结合自由能的经验计算方法119

4.5 结语132

参考文献133

第五章 定量构效关系141

5.1 引言141

5.2 二维定量构效关系分析方法141

5.3 3D-QSAR方法165

5.4 QSASR的应用174

5.5 结语187

参考文献188

第六章 药效基团模型196

6.1 引言196

6.2 药效基团的概念及用途198

6.3 活性构象205

6.4 分子叠合方法206

6.5 药效基团的建立和评估的理论计算方法211

6.6 受体排斥体积和受体必需体积213

6.7 三维药效基团模型及应用举例214

6.8 结语222

参考文献223

第七章 三维结构数据库搜寻228

7.1 引言228

7.2 三维结构的来源228

7.3 二维结构搜寻233

7.4 三维结构搜寻234

7.5 有关三维结构搜寻的软件241

7.6 应用举例244

7.7 结语249

参考文献250

第八章 分子对接255

8.1 引言255

8.2 分子对接法的基本原理255

8.3 Docking256

8.4 Dock257

8.5 AutoDock262

8.6 FlexX266

8.7 FlexiDock270

8.8 分子对接在药物设计中的应用273

8.9 结语277

参考文献277

第九章 全新药物设计282

9.1 引言282

9.2 全新药物设计概述283

9.3 全新药物设计方法285

9.4 结语299

参考文献300

第十章 组合化学与药物设计309

10.1 引言309

10.2 化学库合成方法简介310

10.3 组合化学中分子差异性设计方法314

10.4 虚拟组合化学库316

10.5 基于结构的药物设计与组合化学的结合325

10.6 结语328

参考文献329

第十一章 二氢叶酸还原酶的作用机理及其抑制剂设计332

11.1 引言332

11.2 作为药物的DHFR抑制剂333

11.3 DHFR的氨基酸序列333

11.4 DHFR的晶体结构及其与抑制剂的作用336

11.5 基于结构的DHFR抑制剂设计351

11.6 结语354

参考文献355

第十二章 HIV蛋白酶抑制剂的设计360

12.1 引言360

12.2 HIV PR的结构360

12.3 与配体(抑制剂)结合后HIV PR的结构特性362

12.4 HIV PR-抑制剂复合物的结构364

12.5 HIV PR抑制剂的设计371

12.6 结语377

参考文献378

第十三章 其他酶抑制剂的设计383

13.1 引言383

13.2 胸苷酸合成酶抑制剂383

13.3 碳酸酐酶抑制剂387

13.4 嘌呤核苷磷酸化酶抑制剂设计393

13.5 中性肽链内切酶抑制剂395

13.6 血管紧张素和NEP二元抑制剂397

13.7 唾液酸酶抑制剂399

13.8 凝血酶抑制剂400

13.9 结语402

参考文献404

第十四章 阿片受体三维结构的模建和配体-受体相互作用研究410

14.1 引言410

14.2 阿片受体选择性配体的研究状况411

14.3 阿片受体的分子生物学414

14.4 阿片受体三维结构的模拟方法417

14.5 μ阿片受体与芬太尼类化合物相互作用的分子模拟431

14.6 δ阿片受体及其与配体相互作用的分子模拟441

14.7 κ阿片受体及其与选择性配体作用的分子模拟448

14.8 阿片孤儿受体三维结构模建及其与配体相互作用研究455

14.9 结语466

参考文献466

附录480

主题词索引480

人名索引484

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