图书介绍
分子模拟 从算法到应用PDF|Epub|txt|kindle电子书版本网盘下载
- （荷）Frenkel，Smit著；汪文川等译 著
- 出版社： 北京：化学工业出版社
- ISBN：7502539522
- 出版时间：2002
- 标注页数：417页
- 文件大小：13MB
- 文件页数：430页
- 主题词：
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分子模拟 从算法到应用PDF格式电子书版下载
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图书目录
1 概述1
第一部分 基本原理9
2 统计力学9
2.1 熵及温度9
2.2 经典统计力学13
2.2.1 各态历经性15
3 Monte Carlo模拟18
3.1 Monte Carlo方法18
3.1.1 重要性抽样19
3.1.2 Metropolis方法21
3.2 基本Monte Carlo算法25
3.2.1 算法26
3.2.2 技术细节27
3.3 尝试移动36
3.3.1 平动36
3.3.2 方位移动40
3.4 应用44
4.1 概念51
4 分子动力学模拟51
4.2 程序52
4.2.1 初始化54
4.2.2 力的计算55
4.2.3 运动方程积分57
4.3 运动方程59
4.3.1 其他算法62
4.3.2 高阶算法65
4.3.3 时间可逆算法的刘维公式65
4.3.4 李雅普诺夫非稳定性69
4.4 混合Monte Carlo71
4.5 计算机实验72
4.5.1 扩散75
4.5.2 测定相关性的n-阶算法80
4.6 一些应用86
第二部分 系综95
5 不同系综中的Monte Carlo模拟95
5.2.1 Monte Carlo模拟96
5.1 一般方法96
5.2 正则系综96
5.2.2 算法的证明97
5.3 微正则Monte Carlo98
5.4 等温等压系综99
5.4.1 统计力学基础99
5.4.2 Monte Carlo模拟102
5.4.3 应用106
5.5 等张力等温系综108
5.6 巨正则系综109
5.6.1 统计力学原理110
5.6.2 Monte Carlo模拟112
5.6.3 算法的证明114
5.6.4 应用116
6 不同系综中的分子动力学119
6.1 恒温下的分子动力学120
6.1.1 Andersen热浴121
6.1.2 Nose-Hoover热浴127
6.1.3 Nose-Hoover链134
6.2 在线优化：Car-Parrinello方法138
第三部分 相平衡143
7 自由能计算143
7.1 热力学积分144
7.2 化学势148
7.2.1 粒子插入法149
7.2.2 其他系综152
7.2.3 重叠分布法154
7.3 其他自由能方法158
7.3.1 多直方图159
7.3.2 接受率法165
7.4 伞形抽样167
8 无界面的共存相173
8.1 Gibbs系综法174
8.1.1 配分函数175
8.1.2 Monte Carlo模拟176
8.1.3 方法的实施179
8.1.4 结果分析185
8.2 应用191
8.3 半巨正则系综194
9 含固体的相平衡202
9.1 热力学积分202
9.2 固体的自由能204
9.2.1 具有不连续势能的原子固体204
9.2.2 具有连续势能的原子固体214
9.3 分子固体的自由能216
9.4 描绘共存曲线219
第四部分 高等方法225
10 约束225
10.1 约束226
10.2 约束及非约束平均231
11 稀有事件237
11.1 理论背景238
11.2 逾越势垒模拟243
12.1 簇249
12.簇移动249
12.2 早期拒受方法255
13 复杂流体258
13.1 偏倚抽样方法259
13.1.1 Metropolis之外的方法259
13.1.2 取向偏倚260
13.2 链状分子267
13.2.1 构型偏倚Monte Carlo267
13.2.2 格子模型268
13.2.3 非格子模型272
13.3 尝试取向的产生278
13.3.1 强分子内部相互作用278
13.4 固定末端286
13.4.1 格子模型286
13.4.2 充分柔性链288
13.5 巨正则系综290
13.5.1 算法291
13.6 Gibbs系综模拟295
13.6.1 算法295
13.7 聚合物之外的模拟298
14 链状分子的自由能300
14.1 作为可逆功的化学势300
14.2 Rosenbluth抽样301
14.2.1 具有离散构象的大分子301
14.2.2 扩展至连续可变形分子306
14.2.3 重叠分布Rosenbluth方法313
14.2.4 递归抽样314
A1 静态响应319
附录A 线性响应理论319
第五部分 附录319
A2 动态响应320
A3 耗散323
附录B 长程作用329
B1 Ewald加和329
B2 其他替代算法338
附录C 节省CPU时间344
C1 Verlet列表344
C2 元胞列表348
C3 Verlet和元胞联合列表351
C4 效率354
附录D 统计误差358
D1 统计性质：体系尺度358
D2 相关函数360
D3 块平均362
附录E 积分方法365
E1 高阶方法365
E2 Nose-Hoover算法366
E3 Nose-Hoover链372
附录F 参考态375
巨正则系综模拟375
附录G Glbbs系综中的统计力学378
G1 Gibbs系综自由能378
G2 Gibbs系综的化学势384
附录H 一些通用算法387
附录I 聚合物的重叠分布391
参考文献395